Національний меморіальний комплекс Героїв Небесної Сотні – Музей Революції Гідності створено на трьох постулатах, яких він дотримується у своїй структурі. За кожною з трьох основ закладу залишено свої функції:
Точна схема запланованого штату установи з розподілом на відділи має такий вигляд (завантажити PDF):
Станом на осінь 2017 року в музеї працюють 23 особи. Очолює заклад Ігор Пошивайло. У вересні 2016 року конкурсна комісія, створена з істориків, музейників і керівників майданівських організацій, одноголосно обрала його генеральним директором. У той час Пошивайло був головою правління ГО "Музей Майдану" та працював заступником генерального директора Національного центру народної культури "Музей Івана Гончара".
Національний меморіальний комплекс Героїв Небесної Сотні – Музей Революції Гідності має такі відділи:
- адміністрація,
- відділ бухгалтерського обліку,
- науково-пошуковий відділ фондової роботи,
- науково-дослідний відділ,
- науково-просвітницький відділ,
- науково-видавничий відділ,
- відділ господарського забезпечення.